問︰瘧疾之因何由，而發瘧疾之理何書最詳，能細述歟？歷來論瘧何家最精，何方最妙，能縷述歟？溫瘧、癉瘧古方甚著，何以不驗歟？ 瘧、夜瘧其說甚多，能辨其故歟？瘧在少陽一經，其輕重深淺亦分上中下三焦臟腑論治，能分剖而明辨歟？外感有風寒暑濕，內傷有痰食瘀阻、有汗無汗、新久虛實，能條分縷晰歟？瘧母、瘧勞能詳病因治法歟？其逐層條對毋忽。
瘧之因由於夏暑，瘧之理詳於《內經》。經曰︰“陰陽上下交爭，虛實更作，陽並於陰，則陰實而陽虛，陽明虛則寒 、鼓頷，巨陽虛則腹背頭項痛，三陽俱虛則陰虛骨寒而痛，寒生於內故中外皆寒，陰氣逆極則複出之陽，陽與陰複並於外則陰虛而陽實，陽盛則外熱，陰虛則內熱，故渴而欲飲水也，此皆得之夏、傷於暑熱。氣藏於肌膚之內腸胃之外營氣之所舍也，此令人汗孔疏，因得秋氣汗出遇風，及得之於浴水遂閉汗孔，暑毒無從發泄，故氣舍於皮膚之內，與衛氣並居。衛氣者，蓋日行於陽夜行於陰，此氣得陽而外出，得陰而內薄，內外相薄，是以日作。其間日作者，由氣之舍深內薄於陰，其道遠，其氣深，其行遲，不能與衛氣俱行，不得皆出，故間日而作也。”讀以上經文，明朗朗如月，後人著作不昌斯言矣（以上瘧因）。
惜無治法，不得不求之後賢，而後賢亦有精當之論，可與經文並行者朱丹溪曰︰“無痰不成瘧。瘧由暑邪舍於營衛，腠理不密，複遇風寒，郁閉汗孔，郁汗成痰，寒熱相搏，故為瘧。其治法，無汗者要有汗，散邪為主，兼補正氣；有汗者要無汗，扶正為主，兼散邪氣。”按丹溪補出痰字，所以易於纏綿。有汗無汗最當明辨於後，秦元宮曰︰“少陽膽為震，為乾之長子，諸陽所從，邪欲入陰而拒之，遂積於經，隨氣行少陽而與邪爭，二陽三陽並而入內為援。由是外無陽而戰栗，頃之陽從外出則大熱，勝複之道也。間日一發者，戰後兩衰不能爭，休息而更戰也。”按︰此條可作經注。
又曰︰“四序五行皆順生，惟夏交秋為火克金，雖有坤土間之，熱極忽涼，火未退而金受製。庚日為伏，是火未退而金潛伏也。立秋後金令當權，而木藉子之勢不肯受製，於是金木相戰。《易》曰︰“戰乎乾是也。瘧病者，金木相戰也。脈弦，木強之征也。然必有外邪交構而禍作。暑邪甚者黨木，寒邪甚者黨金。始則金先犯木，木火退而身寒；繼則木出相爭而大熱，此其常也。木火強者木先犯金，先熱後寒，變也。但熱不寒者癉瘧，木火太旺，肺金束手無權，不得不用石膏、知母以瀉其子，治法以助金為正理，以講和為善術，柴胡疏肝，黃芩助肺金，甘草調和，半夏驅邪，而陰用人參、生薑補肺金為左袒，使相和而止，甚則膏知以助金，歸桂以和肝。若虛人胃嘔吐不堪，用人參薑皮專補肺金，使木不敢交鋒，大兵壓勝法也。露一宿者，藉秋氣之助金也。”按︰此條精當奇確，在諸家之上，能清其界（以上語諸家）。
薛一飄曰︰“瘧邪皆得自夏秋浴水淒風，俞穴留邪與衛氣相遇乃作。”《內經》溫瘧論謂︰“冬寒藏於少陰，大暑用力而發，皆紙上空談，仲景之白虎桂枝用之不見其撤熱之功，反見營熱煩躁之害，石膏徒足郁邪，桂枝反熱其營，故不中病情。余製一方，治溫瘧、癉瘧頗效，名清瘧飲，用青蒿、炒蜀漆、知母、花粉、淡芩、鱉甲、丹皮，取蜀漆苦辛引達瘧邪，知、芩、花粉、苦鹽清肺胃之熱，鱉甲、丹皮、辛鹽、清鹽以破肝血，其症自愈，然不能速治，不可急，急則生變。”按︰此條知今日但熱不寒之癉瘧，與古人方論不合，當另出心裁（溫瘧癉瘧）。
三日一發為 瘧，以氣虛不能抵受暑邪，邪氣深陷故也。先哲皆以大補元氣為主，立齋用參朮煨薑頓服即止，丹溪用大劑補中益氣加煨薑亦妙。其有不效者因暑邪未清，先宜清暑益氣湯，驅散暑邪補養正氣，再用溫補。其病在脾肝腎，方詳下焦瘧中（ 瘧）。
夜瘧者，諸書皆作陰分受邪，惟汪石山謂陽虛陷入，當用助氣藥加血藥引入陰分，如四君加羌、防、柴、桂升接三陽，芎、歸、桃仁引入陰分以出還陽分。按︰此條論夜瘧，宜與分晰。三四發後漸入陰分者，從陽虛陷入，宜上法；若初起即發於夜，是陰分受邪，宜桂枝桃仁湯直散血中之邪。薛氏清瘧飲、追瘧飲亦治熱入營中之瘧，（夜瘧）。
上焦之瘧，舌白濁飲、咳嗽頻仍，寒從背起，名曰肺瘧，最忌小柴胡，以肺去半表半裡甚遠，不得引邪深入，用杏、蔻、翹、桑、芩、滑輕宣肺氣，無使邪聚則愈（肺瘧）。昏狂譫語、煩渴者曰心瘧，加減銀翹湯，甚則牛黃丸、紫雪丹（心瘧）。
中焦之瘧變化最多，大約不外胃熱脾濕兩種。濕瘧見瘡，蒼朮、白虎加草果，此胃熱也。胸中痞結，邪漸入陰，草果、知母、半、朴、芩、粉、薑、梅湯，此脾濕也。惟草果能治太陰獨勝之寒，能升邪使出；朴、半助之；知母能瀉陽明獨勝之熱，花粉佐之；薑、半開痞，梅、芩清熱和肝，此從清脾達原兩方化裁而出，實瘧門之主方，用之善於剪裁可也。傷胃陰者味變酸濁，加減瀉心湯；不複者麥冬、麻仁、白芍、首烏、烏梅、知母（胃瘧）。
脾瘧多嘔，熱聚心胸，芩、連、枳、芍、薑、半；燥甚者，牛黃丸︰脈濡腹滿肢冷，露薑飲；嘔吐噫氣，腹鳴溏泄，參、薑、草果、青皮、陳、半；久不止者氣虛，補中益氣；偏熱重者，青蒿鱉甲飲；少陽如傷寒者，小柴胡，熱多加花粉，寒多加乾薑；舌白、脘悶、肢冷、渴喜熱飲，濕蘊之故，濃朴草果湯（脾瘧）。
下焦之瘧皆三陰 瘧。在太陰脾者腹脹、不渴、嘔水，溫脾湯，草果、桂、朴、苓、漆、生薑；在少陰腎者形寒、嗜臥、舌淡、脈微，扶陽湯，鹿茸、參、附、歸、桂、漆；在厥陰者痞結、氣逆、欲嘔，減味烏梅丸，朮、附、參、橘、歸。此皆下焦法也（以上三焦）。
風瘧，惡風、自汗、脈浮，桂枝羌活湯（羌桂防草）；無汗加麻黃，嘔加陳半（風瘧）。
寒瘧，惡寒、無汗、脈緊，麻黃羌活湯（即前方加麻黃）。暑瘧，面垢、口渴、熱退亦常自汗，白虎湯（暑瘧）。
濕瘧，小便不利、骨節重痛而煩、脹滿、自汗，滲濕東加柴、芩，或胃芩東加黃芩（濕瘧）。
痰瘧，痰涎潮壅，二陳加常山、枳實、柴芩（痰瘧）。
食瘧，惡食、吞酸、噯氣、膈中不寬，平胃散加砂仁、草果、神曲、青皮（食瘧）。
瘀阻，即陰分夜瘧之一種，桂枝桃仁湯（瘀阻）。久瘧無汗，屬氣虛，宜撫元氣，不宜散，雖屬有汗、仍身疼怕風，此汗未徹，仍須汗之。初發多汗，當清暑疏風；無汗寒多，風寒未散，煩熱多汗，暑熱未清，氣虛者，參朮苓 人參養營湯；血虛者，何首烏散（有汗、無汗、新久、虛實）。
瘧邪日久不散，私結營壘於肝木之部，名曰瘧母，宜鱉煎丸。常在左脅結癖，其延久氣血衰而寒熱時作者瘧勞，仍當從陰陽偏處調補。